Ketika sebuah pesawat mendarat di New York City dan semua penumpangnya tewas, Dr. Ephraim Goodweather, kepala Canary Project CDC, dan timnya dipanggil untuk menyelidikinya. Pegadaian Harlem, Abraham Setrakian, bergegas ke bandara, yakin bahwa apa yang awalnya tampak seperti wabah virus misterius mungkin merupakan awal dari sesuatu yang jauh lebih jahat.
